Základními studijními směry FTK UP jsou: studium učitelství tělesné výchovy, fyzioterapie, aplikované tělesné výchovy, rekreologie, tělesné výchovy a sportu, ochrany obyvatelstva a managementu sportu a trenérství. Magisterské studium je koncipováno jako pětileté a dvouleté navazující, bakalářské studium jako tříleté. Na fakultě je rovněž realizován doktorský studijní program oboru kinantropologie. Bakalářské studium fyzioterapie, magisterské studium učitelství tělesné výchovy, navazující magisterské studium fyzioterapie a navazující magisterské studium rekreologie probíhá pouze formou prezenční. Studijní programy Aplikované tělesné výchovy a bakalářské studijní programy Rekreologie, Tělesná výchova a sport i Ochrana obyvatelstva uskutečňuje fakulta ve formě prezenční i kombinované. Bakalářský studijní program Management sportu a trenérství probíhá pouze ve formě kombinované. Doktorský studijní program oboru Kinantropologie je realizován ve formě prezenční i kombinované. Magisterský a bakalářský studijní program Aplikované tělesné výchovy nabízí fakulta i studentům se zdravotním postižením, kteří splňují požadavky sportovní mobility. Fakulta tělesné kultury vytváří podmínky pro rekvalifikaci a uskutečňuje licenční studium specialistů pro tělovýchovné organizace, sportovní svazy aj.